%0 Journal Article
%A 顾云婧
%A 潘以红
%A 朱东月
%A 朱 平
%T 基于加权网络的卵巢癌可变剪接预后特征分析
%D 2019
%R 
%J 生命科学研究
%P 444-451
%V 23
%N 6
%X 摘 要: 可变剪接作为转录调节的调控机制, 对肿瘤的治疗和预后具有重要意义。本文对卵巢癌预后相关的可变剪接事件进行了系统分析, 以挖掘可变剪接在卵巢癌中的预后价值。首先, 从TCGASpliceSeq数据库中下载卵巢癌患者数据, 运用单因素Cox回归分析筛选得到290个与预后相关的剪接事件(prognostic-associated alternative splicing events, PASEs); 其次, 融合PASEs对应基因的蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)数据构建卵巢癌预后加权网络, 同时对网络进行拓扑分析, 对PASEs对应基因进行功能富集分析; 最后, 根据网络中节点的度选出前20个可变剪接事件作为预后特征, 利用Cox比例风险模型建立卵巢癌预后预测模型。结果显示, 这些可变剪接事件作为预后特征可以较好地预测卵巢癌患者的预后情况, 可作为潜在的卵巢癌预后生物标志物。
%U https://smkx.hunnu.edu.cn/CN/abstract/article_2255.shtml